2017.4.18-20 基因组关联分析技术应用培训班

时间: 2017-4-18 至 2017-4-20
地点:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼
主办单位: 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位: 北京市计算中心
协办单位: 云计算关键技术与应用北京市重点实验室 中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 中国生物工程杂志 北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
支持单位: 云计算关键技术与应用北京市重点实验室 中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 中国生物工程杂志 北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
官方网址: http://bioc.bcc.ac.cn/bcc/China/shengwuxinxipeixun/
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会议简介

基因组关联分析技术应用培训班

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 

            中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 

            北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 

            中国生物工程杂志 

            北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间2017418-420  上午930-1200,下午1330-1730

日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

1、基因组学与生物信息学概述;

2、基于群体遗传的数据获取;

3、基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;

4、常用GWAS数据库介绍;

Plink软件基础应用

5、Plink软件应用;

6、Plink文件格式生成与解析;

7、等位基因频率计算;

8、 哈-温平衡计算;

9、 目标区域数据提取;

10、基因组关联分析流程;

11、关联分析结果分析与p校正;

第二天

基因型填充Imputation

12、基因型填充Imputation的原理及应用;

13、Beagle软件介绍与应用;

14、基因组填充的方法与分析流程;

15、1000G数据应用

Plink软件进阶应用

16、基于家系的关联分析;

17、曼哈顿图的绘制与结果展示;

18、SNP位点的condition分析;

19、   Meta gwas数据分析;

第三天

Haploview软件

20、Haploview软件应用;

21、Haplotype单倍型分析;

22、LD连锁不平衡指数计算;

23、SNP marker之间的r2、D值等计算;

Tassel软件

24、Tassel软件应用;

25、Tassel基于命令行的批量数据分析;

26、生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

 

  (课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

【培训特色】

无需任何计算机语言基础

深入简出,内容精要实用

结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授

统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用

边学边练,重实践,力求实效

小班授课,个别辅导

【报名费用】注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款 

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  

    开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里备注上:生物计算事业部——您的姓名

【报名优惠政策】
1、2017年3月15日前报名并缴费,可享受减免300元优惠;

2、3人以上团体报名每人可减少400元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

【联系咨询】QQ:2814500767
 于老师   010-59341771,15600660904,邮箱:yurt@bcc.ac.cn

员老师   010-59341773,18701529461, 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

联系方式

联系人:于瑞婷

E-mail:

电 话:010-59341771

地 址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼

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