基因组关联分析技术应用培训班

时间: 2017-4-18 至 2017-4-20
地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼
主办单位: 北京市计算中心生物计算事业部
承办单位: 北京市计算中心生物计算事业部
发布基因组关联分析技术应用培训班的新闻报道   订阅会议
                  报名已结束,你可订阅会议
会议简介

无标题文档

基因组关联分析技术应用培训班

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 
中国生物工程杂志 
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 
举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间2017年4月18日-4月20日  上午9:30-12:00,下午13:30-17:30

日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

  1. 1、 基因组学与生物信息学概述;
  2. 2、 基于群体遗传的数据获取;
  3. 3、 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;
  4. 4、 常用GWAS数据库介绍;

Plink软件基础应用

  1. 5、 Plink软件应用;
  2. 6、 Plink文件格式生成与解析;
  3. 7、 等位基因频率计算;

8、 -温平衡计算;

9、 目标区域数据提取;

10、 基因组关联分析流程;

11、     关联分析结果分析与p校正;

第二天

基因型填充Imputation

12、 基因型填充Imputation的原理及应用;

13、 Beagle软件介绍与应用;

14、 基因组填充的方法与分析流程;

15、 1000G数据应用

Plink软件进阶应用

16、 基于家系的关联分析;

17、 曼哈顿图的绘制与结果展示;

18、 SNP位点的condition分析;

19、     Meta gwas数据分析;

第三天

Haploview软件

20、 Haploview软件应用;

21、 Haplotype单倍型分析;

22、 LD连锁不平衡指数计算;

23、 SNP marker之间的r2D值等计算;

Tassel软件

  1. 24、 Tassel软件应用;
  2. 25、 Tassel基于命令行的批量数据分析;
  3. 26、 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

  (课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导
【报名费用】注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款 
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、2017年3月15日前报名并缴费,可享受减免300元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【联系咨询】QQ:2814500767
于老师   010-59341771,15600660904,邮箱:yurt@bcc.ac.cn
员老师   010-59341773,18701529461, 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

联系方式

联系人:员老师

E-mail:

电 话:010-59341773

地 址:海淀区丰贤中路7号

网友评论
获取及时会议通知
»更多特别专题 >>
»更多会议资讯 >>
»更多相关会议 >>

合作伙伴